#NEXUS [MacClade 4.0 registered to Botany Department, University of Tennessee University of Tennessee] BEGIN DATA; DIMENSIONS NTAX=26 NCHAR=648; FORMAT DATATYPE=DNA MISSING=- GAP=# MATCHCHAR=. INTERLEAVE ; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100] [ . . . . . . . . . .] T.rivale tcgagatgcg aaatatgacc ggaagactgt gaactcgtta acgaa-tg-t cgattctggt ggagggttcg tcctgaagcc aa-tgcccc- tgcccc--tt [100] T.govanianum .......a.. ....g..g.. .......... ........g. .....-..-. ......c... .......... ...c...... ..-......- .t....--.. [100] D.fargesii .......aat .......gt. ......t... ........g. .g...-..a. -....a.... .......... ...c...... ..-a.....- .a.aa.cc.. [100] D.polyphylla .......a.. ....g..gt. ......t... .....t..g. .....-..a. -....a.... ...a...... ...c...... ..-a.....- .a.a..cc.. [100] D.thibetica .......a.t ....g..gt. ......t... ........g. .....-..a. -....a.... .......... ...c...... ..-a....t- .a.a..cc.. [100] D.violacea .......a.t ....g..gt. ......t... .....t..g. .....-..ac -a...a.... .......... ...c...... ..-a.....- .a.a..ca.. [100] K.japonica .......a.a ....g..gt. .......... ........g. ..a..-..aa -a...a.... .........a .......... ..-....t.- .a...t--.. [100] P.incompleta .......at. ....g.ag.t .......... ........g. .t...-..a. -....t.... .......c.. .......... ..-.a....- .....t--.. [100] P.tetraphylla .......at. .......g.. .......ca. ........g. .....-..a. -....t.... .......c.. .......... ..-......- ....t.--.. [100] P.verticillata .......a.. ....g..g.. .......... ........g. .....-..a. -....t.... .......c.. .......... ..-......- ......--.. [100] T.chloropetalum .......a.. ....g..g.. .......... ........g. .....-..a. .......... ........t. ...c...... ..-......- ......--.. [100] T.decipiens .......at. ....g..g.. .......... ........g. .....-..a. .......... ........t. ...c...... ..-......- ......--.. [100] T.discolor .......a.. ....g..g.. .......... ........g. .....-..a. .......... ........t. ...c...... ..-......- ......--.. [100] T.lancifolium .......a.. ....R..g.. .......... ........g. .....-..a. .......... ........t. ...c...... ..-......- ......--.. [100] T.maculatum .......a.. ....g..g.. .......... ........g. .....-..a. .......... ........t. ...c...... ..-......- ......--.. [100] T.petiolatum .......a.. ....g..g.. .......... ........g. .....-..a. .......... ........aK ...c...... ..-......- ......--.. [100] T.recurvatum .......a.. ....R..g.. .......... ........g. .....-..a. .......... ........t. ...c...... ..-......- ......--.. [100] T.reliquum .......a.. ....g..g.. .......... ........g. .....-..a. .......... ........t. ...c...... ..-......- ......--.. [100] T.sessile .......a.. ....g..g.. .......... ........g. .....-..a. .......... ........t. ...c...... ..-......- ......--.. [100] T.camschatcense .......a.. ....g..gt. .......... ........g. .....a.aa. .....t.... .......... ...c...... ..-....t.- ......--.. [100] T.erectum .......a.. ....g..gtg .......... ........g. .....-..a. .......... .......... ..tc...... ..-......- ......--.. [100] T.grandiflorum .......a.. ....g..g.. .......... ........g. .....-..ac .....tc... .......... ...c.....t ..-......- ..t...--.. [100] T.ovatum .......a.. ....g..g.. .......... ........g. .....-..ac .......... .........a ...c...... ..-......- ......--.. [100] T.pusillum .......a.. ....g..g.. .......c.. ........g. .t...-..ac .......... .......... .......... ..a......c ......--.. [100] T.rugelii .......a.. ....g..gtg .......... ........g. .....-..a. .......... .......... ..tc...... ..-......- ......--.. [100] T.undulatum .......a.. ....g..g.. .......... ........g. .....-..a- ......c... .........a .......... ..-c.....- ......--.. [100] [ 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200] [ . . . . . . . . . .] T.rivale gagccgaaag cgggccatgg gcatcgtgcg gtg-catgtg t--tggt--g gggcgctaac aaaattcgac gcagcatgcg tcaaggaacg agtacgtgaa [200] T.govanianum ...t...... ........a. ..g.g.c... .c.-..g... .--g...-g. .......... ....cc..g. ......c... .......... .......... [200] D.fargesii ...t...... g.a.....a. ..g.g.c--- ac.a.gca.. .gtg...--. .......... ....c...g. ...a..a... .......... ....t..... [200] D.polyphylla ...t...... g.a.....a. ..g.g.c--- ac.g.gca.. .gtg...--. .......... ....c...g. ...a..a... ........t. ....t..... [200] D.thibetica ...t...... g.a.....a. ..g.g.c--- ac.g.g.a.. .gtg...--. ...t...... ....c...g. ...a..a... .......... ....t..... [200] D.violacea ...t...... g.a.....a. ..g.g.c--- ac.g.gca.. .gtg...--t .......... ....c...g. ...a..a... .......... ....t..... [200] K.japonica ...t...... ..a.....aa ..g.g.c--- ac.g.gca.. .gtg...--t .......... ....cc.... ...a..c... ........t. ....t..... [200] P.incompleta ...t...... ..a.....a. ....g.c--- ac.a.g.a.. .gtg...gg. .......... .....c.... .......... .......... .......... [200] P.tetraphylla ...t...... ..a.....a. ....g.c--- ac.g.gca.. .gtg...gg. ...t...... ....cc...t ......c... .........t .......... [200] P.verticillata ...t...... ..a.....a. ....g.c--- ac.g.gca.. .gtg...-g. .......... ....cc.... ...a..c... .......... .......... [200] T.chloropetalum ...t...... ..a.....a. ..g.g.c... .c.-..c... .--g.ac-g. .......... ....cc..g. ...a..c... .......... .......... [200] T.decipiens .........t ..a.....a. ..g.g.c... .c.-..c... .--g.ac-g. .......... ....cc..g. ...a..c... .......... .......... [200] T.discolor ...t.....t ..a.....a. .Yg.g.c... .c.-..c... .--g.ac-g. .......... ....cc..g. ...a..c... .......... .......... [200] T.lancifolium ...t...... ..a.....a. ..g.g.c... .c.-..c... .--g.ac-g. .......... ....cc..g. ...a..c... .......... .......... [200] T.maculatum ...t...... ..a.....a. ..g.g.cR.. .c.-..S... .--g.ac-g. .......... ....cc..g. ...a..c... .......... .......... [200] T.petiolatum ...t...... ..a.....a. ..g.g.c... .c.-..c... .--g.ac-g. .......... ....cc..g. ...a..c... .......... .......... [200] T.recurvatum ...t...... ..a.....a. ..g.g.c... .c.-..c... .--g.ac-g. .......... ....cc..g. ...a..c... .......... .......... [200] T.reliquum ...t.....t ..a.....a. ..g.g.c... .c.-..c... .--g.ac-g. .......... ....cc..g. ...a..c... .......... .......... [200] T.sessile ...t...... ..a.....a. ..g.g.c... .c.-..g... .--g.ac-g. .......... ...tcc..g. ...a..c... .......... .......... [200] T.camschatcense ...t...... ........a. ..g.g.c... ac.-..a..a .--g...aa. .......... ....cc..g. ......c... .......... .......... [200] T.erectum ...tt..... ........a. ..g.g.c... ac.-..c... .--g...-g. .......... ....cc..g. ......c... .......... .......... [200] T.grandiflorum .t.t...... ........a. ..g.g.c... ac.-..c... .--g...-g. ......c... ....cc..g. ...a..c... .......... .......... [200] T.ovatum ..at...... t.......a. .tg.g.c... ...-...... .--g...-g. .......... ....c...g. ...a..c... .......... .......... [200] T.pusillum .g.t..t... ........a. ..g.g.c... ac.-..c... .--g...-g. ....a..... ....c...g. ...a..c... .......... .......... [200] T.rugelii ...tt..... ........a. ..g.g.c... ac.-..c... .--g...-g. .......... ....cc..g. ......c... .......... .......... [200] T.undulatum ...t...... ........a. ..g.g.c... .c.-..g... .--g..c-g. .......... ....cc..g. ......c... .......... .......... [200] [ 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300] [ . . . . . . . . . .] T.rivale tgcgg-ccca ccgtcatt-g cctgacacgt ggtggtggta tgtttcgcag agtaatttta tgactcccgg caacggatat cttggctccc gtatcgatga [300] T.govanianum .....-.... .t......-. g....tga.. ...cc---.. .......... .......... ......t... .......... .......... .......... [300] D.fargesii .a..a-.... tt......a. ..-..tca.. ...ct---.. .......... .......... ......t... .......... .....a.... .......... [300] D.polyphylla .a...-.... .t......a. a-...tca.. ...ct---.. ......a... .......... ......t... .......... .......... .......... [300] D.thibetica .....-.... .t......-. g....tca.. ...ct---.. .......... .......... ......t... .......... .......... .......... [300] D.violacea .....-..-. .t......a. .-...tga.. ...c.---.. ......a... .......... ......t... .......... .......... .......... [300] K.japonica .....-.... .t...t..-. gtc..tg... ...cc---.. .......... .......... ......t... .......... .......... .......... [300] P.incompleta ..a..-..t. .t-.....-. gt...tga.. ...cc---.. .......t.. .......... ......t... .......... .......... .......... [300] P.tetraphylla ..a..-.... .t......-. gt...tta.. ...cc---.. .......t.. .......... ......t... .......... .......... .......... [300] P.verticillata ..a..-.... ........-. gt...tga.. ...cc---.. .......t.. .......... ......t... .......... .......... .......... [300] T.chloropetalum .....g.... .t......-. g....gca.. ...cc---.. .......... .......... ......t... .......... .......... .......... [300] T.decipiens .....g.... .t......-. gt...gca.. ...cc---.. .......... .......... ......t... .......... .......... .......... [300] T.discolor .....g.... .t......-. g....gca.. ...cc---.. .......... .......... ......t... .......... .......... .......... [300] T.lancifolium .....g.... .t......-. gM...gca.. ...cc---.. .......... .......... ......t... .......... .......... .......... [300] T.maculatum .....g.... .t......-. g....gca.. ...cc---.. .......... .......... ......t... .......... .......... .......... [300] T.petiolatum .....g.... .t......-. g....gca.. ...cc---.. .......... .......... ......t... .......... .......... .......... [300] T.recurvatum .....g.... .t......-. g....gca.. ...cc---.. .......... .......... ......t... .......... .......... .......... [300] T.reliquum .....g.... .t......-. g....gca.. ...cc---.. .......... .......... ......t... .......... .......... .......... [300] T.sessile .....g.... .t......-. g....gca.. ...cc---.. .......... .......... ......t... .......... .......... .......... [300] T.camschatcense -....-.... .t......-. g....gca.. ...cc---.. ......t... .......... ......t... .......... .......... .......... [300] T.erectum .....-.... .t......-. g....tca.. ...cc---.. ......t... .......... ......t... .......... .......... .......... [300] T.grandiflorum .....-.... .t......-. g....tca.. ..gct---.. .......... .......... ......t... .......... .......... .......... [300] T.ovatum .....-.... .t......t. gt...gcat. ...cc---.. .....t...t .......... ......t... .......... .......... .......... [300] T.pusillum .....-.... .t......-. g...tgca.. ...cc---.. .a........ .......... ......t... .......... .......... .......... [300] T.rugelii .....-.... .t......-. g....tca.. ...cc---.. ......t... .......... ......t... .......... .......... .......... [300] T.undulatum .....-.... .t......-. g....tga.. ...cc---.. .......... .......... ......t... .......... .......... .......... [300] [ 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400] [ . . . . . . . . . .] T.rivale agaacgtagc gaaatgcgat acttgatgtg aattgcagaa tcccgtgaat catcgagttt ttgaacgcaa gttgcgcccg atgccattcg acagagggca [400] T.govanianum .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... g......... [400] D.fargesii .......... .......... .......... .......... .......... ........c. .......... .......... ...t...... g..a...... [400] D.polyphylla .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ...t...... g..a...... [400] D.thibetica .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ...t...... g..a...... [400] D.violacea .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... g..a...... [400] K.japonica .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... [400] P.incompleta .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... g......... [400] P.tetraphylla .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... g......... [400] P.verticillata .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... g......... [400] T.chloropetalum .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... g......... [400] T.decipiens .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... g.g....... [400] T.discolor .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... g.g....... [400] T.lancifolium .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... g......... [400] T.maculatum .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... g......... [400] T.petiolatum .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... g......... [400] T.recurvatum .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... g......... [400] T.reliquum .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... g.g....... [400] T.sessile .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... g......... [400] T.camschatcense .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... g.t....... [400] T.erectum .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... g.t....... [400] T.grandiflorum .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... g......... [400] T.ovatum .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... g......... [400] T.pusillum .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... g......... [400] T.rugelii .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... g.t....... [400] T.undulatum .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... g......... [400] [ 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500] [ . . . . . . . . . .] T.rivale cgtctgcctg ggcgtcacgt cctgcgtcgc tcagtgccaa ttgcgctcgt gg-----aag tgttgcatgg atgcggagat tggcctcctg tgccc-ttgt [500] T.govanianum ..c....... .......... .t........ ..g....... c.....c... ..gtcga... ...g...c.. .........c ........c. .....-...g [500] D.fargesii ..c....... .......... .t........ ..g....... c.a...ct.. ..gtcga... .t.g...c.. ...t...... ........c. ..t..-.... [500] D.polyphylla ..c....... .......t.. .t........ ..g....... c.at..c... ..gtcga... .t.g...c.. ...t...... .......tc. ..t..-.... [500] D.thibetica ..c....... .......... .t........ ..g....... c.a.t.ct.. t.gtcga... .t.g...... .......... .......tc. ..t..-.... [500] D.violacea ..c....... .......... .t........ ..g....... c.a...c... ..gtcga... ...g...ct. ...t...... .......tc. ..t..-.... [500] K.japonica ..c....t.. .......... .t..ta.... ..g....... c....a.a.. ..gtcga... ...g...... ...t...... ........c. ....t-.... [500] P.incompleta ..c....... .......... .t...a.... ..g....... c.a....... ..gtcga... .a.g...ct. .......... .......... .....-.... [500] P.tetraphylla ..c....... .......... .t........ ..g....... c.a....... ..gtcga... .t.g...c.. .......... .......... .....-.... [500] P.verticillata ..c....... .......... .t........ ..g....... c.a...c... ..gtcaa... ...g...c.. .......... .......... .....-.... [500] T.chloropetalum ..c....... .......... .t........ ..g....... c.....c... ..gtgga... gt.g...c.. .........c .....c.... .....-.... [500] T.decipiens ..c....... .......... .t........ ..g....... c.....c... ..gtcga... gt.g...c.. .........c .....c.... .....c-... [500] T.discolor ..c....... .......... .t........ ..g....... c.....c... ..gtcga... ga.g...c.. .........c ..a..c.... .....-.... [500] T.lancifolium ..c....... .......... .t........ ..g....... c.....c... ..gtgga... gt.g...c.. .........c .....c.... .....-.... [500] T.maculatum ..c....... .......... .t.R...... ..g....... c.....c... ..gtgga... gt.g...c.. .........c .....c.... .....-.... [500] T.petiolatum ..c....... .......... .t........ ..g....... c.....c... ..gtgga... gt.g...c.. .........c .....c.... .....-.... [500] T.recurvatum ..c....... .......... .t........ ..g....... c.....c... ..gtgga... gt.g...c.. .........c .....c.... .....-.... [500] T.reliquum ..c....... .......... .t........ ..g....... c.....c... ..gtcga... gt.g...c.. .........c .....c.... .....c-... [500] T.sessile ..c....... .......... .t........ ..g....... c.....c... ..gtgga... gt.g...c.. .........c .....c.... .....-.... [500] T.camschatcense ..c....t.. .........c .t........ ..g....... .......... ..gtcga... gt.g...c.. .......... ........c. .....c.... [500] T.erectum ..c....t.. .........c .t........ ..g....... c......... ..ttcga... .t.g...c.. .......... .......... .....-.... [500] T.grandiflorum ..c....... .......... .t........ ..g....... c.a...c... ..gtcga..t .t.g...c.. .........c ..a..c..c. a....-.... [500] T.ovatum ..c....... .......... .t........ ..g....... c...a.at.. ..gtcga... gt.g...c.. .........c .....c.... .....-.... [500] T.pusillum ..c....... .........c .t........ ..g....... c.a...c.a. ..gtcga..t gt.g...c.. .........c .....c..c. .a...-..a. [500] T.rugelii ..c....t.. .........c .t........ ..g....... c......... ..ttcga... .t.g...c.. .......... .......... .....-.... [500] T.undulatum ..c....... .......... .t........ ..g....... c.....c... ..gtcga... ...g...c.. .........c .......... .....-...g [500] [ 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600] [ . . . . . . . . . .] T.rivale gcgcg--gtg ggttgaagag t--gggat-- gccagcggag acggacatgg cgagtggtgg atacgagccg gacgtcgtgg tcttctcctc taatggctcg [600] T.govanianum .....cg... .......... .--.....-- ....a..... .......c.. .......... ..g....... .......... ...cg..... ...a...... [600] D.fargesii .....cg..a .......... .--.....-- ....at.... .......c.. .......... ...t...... .......... ...cg..... ...a...... [600] D.polyphylla .....cg..a ..c.a..... .--.....-- ....a..t.. .......c.. .......... ..g....... .......... ...cg..... ...a...... [600] D.thibetica ..a.acg..a .......... .--.....-- ....a..... .......c.. .......... ..gt...... .......... ...cg..... ...a....t. [600] D.violacea a....cg..a ..c....... .--.....-- ....a..... .......c.a t......... ..g....... .......... ...cg..... ...a...... [600] K.japonica ...t.cg... ........g. .--.a...-- ....a..... .......c.. .......... .ag....... .......... ...cg.g... ...a...... [600] P.incompleta ...t.ca... .......... .--.....at ....a..... .......c.a .......... ..g....... .......... ...ca..... ...a...... [600] P.tetraphylla ....acg..a ........c. .gt.....-- ....at.... .......c.a .......... ..g....... .......... ...ca..... ...a...... [600] P.verticillata .....cg... .......... .--.....-- ....a..... .......c.a .......... ..g....... .......... ...cg..... ...a...... [600] T.chloropetalum .....cg... .........t .--.....-- ...ga..... .......c.. .......... ..g....... .......... ...cg..... ...a...... [600] T.decipiens .....cg... .........t .--.....-- .t.ga..... .......c.. .......... ..g....... .......... ...cg..... .g.a...... [600] T.discolor .....cg... .........t .--t....-- .t.ga..... .......c.. .......... ..g....... .......... ...cg..... .g.a...... [600] T.lancifolium .....cg... .........t .--.....-- ...ga..... .......c.. .......... ..g....... .......... ...cg..... ...a...... [600] T.maculatum .....cg... .........t .--.....-- ...ga..... .......c.. .......... ..g....... .......... ...cg..... ...a...... [600] T.petiolatum .....cg... .........t .--.....-- ...ga..... .......c.. .......... ..g....... .......... ...cg..... ...a...... [600] T.recurvatum .....cg... .........t .--.....-- ...ga..... .......c.. .......... ..g....... .......... ...cg..... ...a...... [600] T.reliquum .....cg... .........t .--.....-- .t.ga..... .......c.. .......... ..g....... .......... ...cg..... .g.a...... [600] T.sessile .....cg... .........t .--.....-- ...ga..... .......c.. .......... ..g....... .......... ...cg..... ...a...... [600] T.camschatcense .....cg... .......... .--.....-- ...ga..... .......c.. .......... ..g....... .......... ...cg..... ...a...... [600] T.erectum .....cg... .......... .--.....-- ...ga..... .......c.. .......... ..g....... .......... ...cg..... ...a...... [600] T.grandiflorum .....cg... .......... .--.....-- ...ga..... g......c.. .......... ..ga...... .......... ...cg..... ...a...... [600] T.ovatum .....cg... .......... .--.....-- ...ga..... ......gc.. .......... ..g....... ..t....... ...cg..... ...a...... [600] T.pusillum .....cg... .......... .--.....-- ...ga..... .......c.. .......... ...t...... .......... ...cg..... ...a...... [600] T.rugelii .....cg... .......... .--.....-- ...ga..... .......c.. .......... ..g....... .......... ...cg..... ...a...... [600] T.undulatum .....cg... .......... .--...c.-- ....a..... .......c.. .......... ..g....... .......... ...cgc.... ...a...... [600] [ 610 620 630 640 ] [ . . . . ] T.rivale gagataact- ccc----aag aa-------- --gggttgcg c--tgcac [648] T.govanianum ...g-----c ...---tt-. tgacacccag ta........ .--..... [648] D.fargesii .g.g------ ...---tt-. tgacacccag tat....... .--..t.t [648] D.polyphylla .g.g-----c ...---tt-a tgacacccaa cat....... .--..t.. [648] D.thibetica .g.ga----- ...---tt-. tgacacccag cat....... .--..t.t [648] D.violacea ...g-----c ...---tt-a tgacacccaa cat....... t--..t.t [648] K.japonica ...t-----c ...---tt-. tgacacccaa ta.....a.. .--..... [648] P.incompleta .g.g-----c ...---tt-. tgacacccag ta........ .--....a [648] P.tetraphylla .gag-----c ...---tt-. tgacacccag ta...c.... .--....a [648] P.verticillata .g.g-----c ...---tt-. tgacacccag ta........ .--....a [648] T.chloropetalum ...g------ ...---ttt. tgacacccag ta........ .--..... [648] T.decipiens ...g------ ...---ttt. tgacacccag ta........ .--..... [648] T.discolor ...g------ ...---ttt. tgacacccag ta........ .--..... [648] T.lancifolium ...g------ ...---ttt. tgacacccag ta........ .--..... [648] T.maculatum ...g------ ...---ttt. tgacacccag ta........ .--..... [648] T.petiolatum ...g------ ...---ttt. tgacacccag ta........ .--..... [648] T.recurvatum ...g------ ...---ttt. tgacacccag ta........ .--..... [648] T.reliquum ...g------ ...---ttt. tgacacccag ta........ .--..... [648] T.sessile ...g------ ...---ttt. tgacacccag ta........ .--..... [648] T.camschatcense ...gg----- ...---tt-. ggacacccag ta........ .--..a.. [648] T.erectum ...gg----- ...---tt-. tgacacccag tat....... .--..a.. [648] T.grandiflorum ...ga----- ...---tt-. tgacacccag ta........ .--..... [648] T.ovatum ...g-----c ...---tt-. tgacacccag ta........ t--..... [648] T.pusillum ...g-----c ...---tt-. tgacacccag ta........ .gc..a.. [648] T.rugelii ...gg----- ...---tt-. tgacacccag tat....... .--..a.. [648] T.undulatum ...g-----c ...---tt-. tgacacccag ta........ .--..... 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